THE PHYSICS GRADUATE PROGRAM invites everyone to the seminar:
Simulações com Dinâmica Molecular: Um “Microscópio Computacional” para o Estudo de Sistemas Biológicos
Prof. Germano Heinzelmann
Departamento de Física/UFSC
Abstract:
A dinâmica molecular (DM) descreve um sistema físico a partir das interações entre seus átomos individuais, sendo atualmente uma importante ferramenta computacional no estudo de estruturas como proteínas e DNA. O aumento significativo da capacidade computacional dos últimos anos, junto com o aprimoramento dos potenciais de interação, proporcionou a simulação dessas macromoléculas em solução por escalas de tempo da ordem de micro e milissegundos. Isso vem ajudando a elucidar uma série de questões em biologia molecular como o dobramento de proteínas, o funcionamento de transportadores ativos e canais de íons, e o mecanismo de ação de diversas drogas e toxinas. Essa evolução também atribuiu à dinâmica molecular uma participação crescente nos primeiros estágios da descoberta de novos fármacos, devido ao seu potencial de estimar a afinidade de um grande número de moléculas de maneira rápida e barata. No presente seminário apresentarei primeiramente a teoria física por trás das simulações em DM, que visam reproduzir um sistema biológico real, e como elas pode ser usadas em conjunto com a Mecânica Estatística para obter grandezas mensuráveis experimentalmente como a variação da energia livre ΔG e a constante de equilíbrio. Em seguida mostrarei uma série de resultados obtidos por mim e outros pesquisadores em diferentes proteínas que funcionam como receptores, transportadores secundários, canais de potássio e leitores de marcadores epigenéticos, e como sua investigação com DM produziu resultados que foram subsequentemente confirmados por experimentos. Finalmente, mostrarei como o avanço sem precedentes nas placas de processamento gráfico (GPUs) tornou simulações com DM da ordem de microsegundos acessíveis sem a necessidade de grandes supercomputadores, possibilitando a colaboração direta entre grupos computacionais e experimentais na Universidade Federal de Santa Catarina.
Date: October 20, 2017 – (friday) – Place: Sala 212 – Auditório do Departamento de Física – Time: 10h15min
The Physics Graduate Program invites everyone to:
Qualifying Examination for Doctoral Thesis
Aldo Matthaeus Cutrim Gomes
PROPRIEDADES MAGNÉTICAS E ELETROQUÍMICAS DE SUPERFÍCIES METÁLICAS
Defense Committee:
Profª. Drª. Maria Luisa Sartorelli – (president) – UFSC/FSC
Profª. Drª. Marta Elisa Rosso Dotto – (local member) – UFSC/FSC
Prof. Dr. Lucas Natalio Chavero – (local member) – UFSC/Blumenau
Drª. Muriel de Pauli – (local member) – UFSC/FSC
Date: October 6, 2017 – friday – Time: 2:00 pm – Place: Sala 114 – Sala de Reuniões do Departamento de Física
THE PHYSICS GRADUATE PROGRAM invites everyone to the seminar:
DESENVOLVIMENTO DE BIOSSENSORES ÓPTICOS IMUNOCROMATOGRÁFICOS*
Gisele Elias Nunes de Pauli – postdoc/UFSC
*Evento de presença obrigatória para os alunos matriculados na disciplina seminários
Resumo:
Os biossensores ópticos baseados no imunoensaio de fluxo lateral (do inglês lateral flow immunoassays – LFIAs) são dispositivos promissores que vem sendo utilizados na detecção de uma variedade de analitos, dentre eles proteínas e toxinas. A aplicação mais conhecida é o teste de gravidez, baseado na detecção de gonadotrofina coriônica humana (do inglês human chorionic gonadotropin – HCG), na urina. As principais vantagens do LFIA são o fácil manuseio, e a análise qualitativa pode ser obtida pela observação dos resultados a olho nu em menos de 30 minutos. Entretanto, o LFIA apresenta algumas limitações importantes, dentre elas, apenas pequenas quantidades de amostra podem ser processadas em cada análise (tipicamente 200 µL). Para superar esse inconveniente, elaboramos um novo dispositivo, o “Lab-in a syringe” (LIS), publicado na revista Lab on a Chip 15, 399 (2015). O LIS é baseado em um simples imunoensaio de fluxo vertical (VFIA) e foi utilizado para a detecção de proteínas, dentre elas o antígeno específico da próstata (do inglês prostate specific antigen – PSA) e Imunoglobulina G humana (HIgG). Assim como a maioria dos outros dispositivos baseados em papel, o LIS é fácil e rápido de ser utilizado. Portanto, estes dispositivos podem ser útil como método de diagnóstico rápido e simples para a detecção de analitos importantes em diferentes campos, tais como: monitoramento ambiental, alimentos e saúde.
Data: 06 de outubro de 2017 – (sexta-feira) – Local: Sala 212 – Auditório do Departamento de Física – Horário: 10h15min
The Physics Graduate Program invites everyone to:
Defense of Doctoral Thesis
Ian Jordy Lopez Diaz
COMPENSATION TEMPERATURE AND CRITICAL BEHAVIOR OF LAYERED ISING MODELS
Defense Committee:
Prof. Dr. Nilton da Silva Branco – (president) – UFSC/FSC
Prof. Dr. João Antônio Plascak – (external member) – UFPB
Prof. Dr. Daniel Girardi – (local member) – UFSC/Blumenau
Prof. Dr. Wagner Figueiredo – (membro titular) – UFSC/FSC
Prof. Dr. Lucas Nicolao – (local member) – UFSC/FSC
Date: October 06, 2017 – friday – Times: 2:00 pm – Place: Sala 212 – Auditório do Departamento de Física
EL PROGRAMA DE POSGRADO EN FÍSICA invita a todos para lo seminario:
Modelo Dinâmico para a Fotogeração de Portadores em Heterojunções Orgânicas
Luis Guilherme de Carvalho Rego – UFSC/FSC
Resumen:
Estudamos a dinâmica do processo de fotogeração de portadores de carga em heterojunções do tipo doador-aceitador (D-A), considerando a natureza quântica do sistema, efeitos de decoerência e recombinação. Para esse estudo desenvolvemos um modelo granular que nos permite modelar heterojunções D-A mesoscópicas, levando em conta efeitos de desordem e orientação moleculares. A decoerência suprime o comportamento ondulatório do exciton, fazendo com que sua dinâmica ocorra no regime difusivo. Além disso, as simulações evidenciam que a decoerência diminui o comprimento de correlação do exciton, reduzindo, portanto, sua taxa de decaimento por recombinação. Esse efeito explica porque excitons produzidos longe da interface contribuem para a geração de portadores livres. Por fim, discuturimos a balanço entre efeitos quântico-coerentes e difusivos no processo de fotogeração de carga em hetero-estruturas orgânicas.
Fecha: 29 de septiembre de 2017 – (viernes) – Lugar: Sala 212 – Auditorio del Departamento de Física – Horário: 10h15min
The Physics Graduate Program invites everyone to:
Qualifying Examination for Doctoral Thesis
Marcelo Salvador
PROPRIEDADES MAGNÉTICAS DE SISTEMAS DE NANOPARTÍCULAS DE DOMÍNIO ÚNICO
Defense Committee:
Prof. Dr. Lucas Nicolao – (president) – UFSC/FSC
Prof. Dr. Rafael Leonardo Novak – (local member) – UFSC – Blumenau
Prof. Dr. Nilton da Silva Branco – (local member) – UFSC/FSC
Prof. Dr. Alejandro Mendoza Coto – (local member) – UFSC/FSC
Date: September 22, 2017 – friday – Time: 2:00 pm – Place: Sala 212 – Auditório do Departamento de Física
THE PHYSICS GRADUATE PROGRAM invites everyone to the seminar:
Contribuição do Tunelamento Quântico para a energia de ativação em reações Químicas induzidas por Micro-ondas
Carlos Alberto Kuhnen / UFSC
Abstract:
Bond breaking, tunneling and bond formation. DOI: 10.1021/acs.jpca.7b04875
Uma abordagem quântica, que considera os efeitos do tunelamento nas reações químicas, é apresentada para explicar o aumento nas taxas de reação em reações induzidas por microondas. Na equação de Arrhenius é levado em consideração a parte do hamiltoniano relativa à energia de interação durante o tunelamento, entre a partícula que está tunelando e o campo elétrico definido no meio, cuja componente espacial é especificada pelo seu valor rms. Uma avaliação aproximada da energia de interação leva a uma dependência linear da energia de ativação efetiva com o campo aplicado. A avaliação do valor rms do campo para líquidos puros e misturas de reação, através de suas propriedades dielétricas conhecidas, leva a uma redução sensível nas energias de ativação para o processo de transferência de prótons nesses líquidos. Os resultados indicam a necessidade de se buscar o uso de métodos mais refinados da química quântica moderna para se calcular com mais precisão as energias de ativação efetivas e as taxas de reação induzidas pelo campo.
Date: September 22, 2017 – (friday) – Place: Sala 212 – Auditório do Departamento de Física – Time: 10 horas
THE PHYSICS GRADUATE PROGRAM invites everyone to the seminar:
VVV-WIT: os objetos variáveis estranhos da Via Láctea
Professor accredited to the PPGFSC / UFSC and researcher in the area of Stellar and Galactic Astronomy
Roberto K. Saito – UFSC/FSC
Abstract:
O projeto VISTA Variables in the Vía Láctea (VVV) é um levantamento público do European Southern Observatory (ESO), de variabilidade no infravermelho próximo, que desde 2010 vem mapeando a região central da Via Láctea e região sul do disco Galáctico. Cobrindo 562 graus quadrados no coração de nossa Galáxia, o projeto vem monitorando cerca de 1 bilhão de fontes, onde de 3 a 4 milhões destas são objetos variáveis das mais diversas classes, de trânsitos planetários à explosões do tipo Nova, estrelas pulsantes, variáveis eclipsantes ou objetos transientes como microlentes gravitacionais. Dentre estas fontes variáveis estão alguns objetos cujo comportamento não se encaixa em nenhuma classe conhecida de variabilidade estelar e que foram catalogados como objetos VVV-WIT ou “VVV-What Is This?” Nesse seminário falaremos sobre os primeiros WIT descobertos e as observações de seguimento que temos realizado para tentar desvendar suas naturezas. Falaremos em especial de VVV-WIT-06, um objeto que apresenta similaridades com a famosa Estrela de Tabby (KIC 8462852), descoberta pelo Satélite Kepler em 2015.
Date: September 15, 2017 – (friday) – Place: Sala 212 – Auditório do Departamento de Física – Time: 10h15min
The Physics Graduate Program invites everyone to:
Qualifying Examination for Doctoral Thesis
Jerdson Americo Silva Serejo
ESTUDO SOBRE NANOESTRUTURAS FORMADAS POR PEROVSKITAS HÍBRIDAS DO TIPO ORGÂNICO-INORGÂNICO
Defense Committee:
Prof. Dr. Luis Guilherme de Carvalho Rego – (president) – UFSC/FSC
Prof. Dr. Ivan Helmuth Bechtold – (local member) – UFSC/FSC
Prof. Dr. Carlos Alberto Kuhnen – (local member) – UFSC/FSC
Prof. Dr. Clederson Paduani – (supplementary member) – UFSC/FSC
Date: September 5, 2017 – tuesday – Time: 10:00 am – Place: Sala 114 – Sala de Reuniões do Departamento de Física
The Physics Graduate Program invites everyone to:
Qualifying Examination for Doctoral Thesis
Murilo Machado Costa
UM ESTUDO ATOMÍSTICO DA FOTOEXCITAÇÃO ACOPLADA À TRANSFERÊNCIA DE CARGA E ENERGIA EM SISTEMAS SUPRAMOLECULARES
Defense Committee:
Prof. Dr. Luis Guilherme de Carvalho Rego – (president) – UFSC/FSC
Prof. Dr. Felipe Arretche – (local member) – UFSC/FSC
Prof. Dr. Jorge Douglas Massayuki Kondo – (local member) – UFSC/FSC
Date: September 4, 2017 – friday – Time: 10:00 am – Place: Sala 114 – Sala de Reuniões do Departamento de Física
